Rudolf Jindrák se dlouhodobě zabývá vztahy se zeměmi střední Evropy. V minulosti působil jako český velvyslanec v Maďarsku, Rakousku a především v Německu, kde vedl ambasádu téměř osm let. Podílel se například na přípravě Česko-německé deklarace. Mezi lety 2014 – 2015 pracoval také jako náměstek ministra zahraničí. Před nástupem do funkce velvyslance České republiky na Slovensku byl několik let ředitelem zahraničního odboru v Kanceláři prezidenta republiky.